Firma
Właściciel
Bilans otwarcia PIT
Bilans otwarcia VAT
KSeF
Ustawienia wysyłki plików JPK V7
Po zalogowaniu do systemu e-Księgowość należy przejść do Ustawień konta i uzupełnić brakujące dane w zakładce Firma, Właściciel, Bilans otwarcia VAT, Bilans otwarcia PIT, KSeF i Ustawienia wysyłki do Urzędu Skarbowego. Pozostałe ustawienia są opcjonalne.
Firma
Po przejściu do zakładki Ustawienia/Firma należy uzupełnić brakujące dane w szczególności w pustych polach oznaczonych gwiazdką.
Kluczowe jest zaznaczenie pola Rodzaj ewidencji, gdyż na tej podstawie system będzie generował KPIR lub Ewidencję przychodu, dla osób rozliczających się na ryczałcie.
Parametry dotyczące Rodzaju opodatkowania uzupełniane są według poniższego schematu:
Aby ustawić parametr Podatnik VAT, kliknij przycisk Zmień, wprowadź zakres dat (od rozpoczęcia działalności do najdalszej możliwej daty) i wybierz odpowiednią wartość: Tak (czynny podatnik) lub Nie (osoba niezarejestrowana do VAT).
W przypadku wątpliwości można skorzystać z niebieskich pytajników uściślających informację.
Na przykład: mimo to, że użytkownik nie jest czynnym podatnikiem VAT należy kliknąć Zmień, wprowadzić daty od - do oraz nie zaznaczać pola przy Podatnik VAT.
Właściciel
Po przejściu do zakładki Właściciel, należy nakierować myszą na trzy niebieskie kropeczki i wybrać Edytuj, dzięki czemu wyświetli się szereg parametrów do uzupełnienia.
W prawym górnym rogu widnieje przycisk Kopiuj dane z Firmy, należy użyć go aby Dane podstawowe zostały przekopiowane z zakładki Firma. Dodatkowo pojawia się przycisk Pobierz dane z GUS na podstawie NIP, wówczas w systemie zostaną zaczytane dane znajdujące się w Głównym Urzędzie Statystycznym.
W Danych podatkowych i Danych do ZUS, analogicznie jak przy parametrach w zakładce Firma, należy kliknąć przycisk Zmień i wybrać zakres dat od rozpoczęcia działalności do najbardziej odległej, określając wartość odpowiednio na Tak lub Nie.
Wymagane jest uzupełnienie wszystkich pól oznaczonych gwiazdka.
W systemie format dat, który jest wprowadzany w większości przypadków obejmuje jedynie miesiąc i rok wyjątkiem są parametry Udział i Uwzględnić kwotę wolną, w których wprowadzamy datę w formacie rok-miesiąc-dzień. W tej sytuacji parametry należy zawsze ustawić na 1 dzień miesiąca, w którym przypada rozpoczęcie działalności, tak aby system prawidłowo generował deklarację.
Dane do ZUS
Ustawienia w sekcji Dane do ZUS mają wpływ na kwotę składek ZUS generowanych automatycznie przez system.
W przypadku tej sekcji należy uzupełnić jedynie te parametry, które dotyczą składek użytkownika.
Bilans Otwarcia PIT
Po przejściu do zakładki Bilans Otwarcia PIT, należy określić pierwszy miesiąc od którego system e-Księgowość będzie wykorzystywany do prowadzenia Podatkowej Księgi Przychodów i Rozchodów (PKPiR).
Jeżeli księgowość za wcześniejsze miesiące danego roku była prowadzona w innym systemie, a następnie została przeniesiona do e-Księgowości w trakcie roku, należy dodatkowo wprowadzić podsumowania poszczególnych kolumn PKPiR lub Ewidencji Przychodów za okres poprzedzający rozpoczęcie pracy w systemie.
Wprowadzone podsumowanie będzie widoczne w KPIR oraz uwzględnione z zaliczce na podatek dochodowy.
Bilans Otwarcia VAT
Bilans otwarcia VAT należ uzupełnić w przypadku posiadanej nadwyżki z deklaracji VAT, które nie były generowane w systemie. Jeśli nie mamy takiej nadwyżki pozostawiamy pola z uzupełnionymi wartościami na 0.
W bilansie otwarcia VAT można również wprowadzić proporcję sprzedaży mieszanej.
KSeF
Panel Ustawienia KSeF w systemie e-Księgowość umożliwia połączenie systemu z Krajowym Systemem e-Faktur (KSeF) poprzez wgranie odpowiednich certyfikatów.
Dzięki podłączeniu certyfikatu możliwe jest:
• automatyczne wysyłanie, odbieranie e-faktur z KSeF,
• korzystanie z funkcji niedostępnych w standardowym systemie Ministerstwa Finansów, takich jak ochrona przed oszustwami (SKAM), powiadomienia o nowych fakturach oraz wygodne płatności.
Pełna instrukcja generowania i dodawania certyfikatów znajduje się w artykule: Generowanie i wgrywanie certyfikatów KSeF 
Ustawienia wysyłki plików JPK_V7
Zakładka Ustawienia wysyłki do Urzędu Skarbowego służy do sparametryzowania ustawień wysyłki deklaracji VAT oraz pliku JPK_V7 do Urzędu Skarbowego. Użytkownicy systemu mają możliwość skorzystania z wysyłki za pomocą kwoty do autoryzacji.
Wysyłanie deklaracji za pomocą kwoty do autoryzacji
Zaznaczenie pola Wyślij kwotą autoryzującą oraz wprowadzenie poprawnej wartości w polu Kwota autoryzująca spowoduje, że wysyłane deklaracje z systemu będą autoryzowane kwotą przychodu z odpowiedniego zeznania rocznego.
Jeśli deklaracja nie będzie wysyłana z systemu, należy zaznaczyć parametr Nie wysyłaj. Będę dostarczać PIT roczny oraz wydruki plików JPK-V7 do Urzędu Skarbowego.
Zaznaczenie pola Wysyłaj na bramkę testową Ministerstwa Finansów służy sprawdzeniu czy format deklaracji jest poprawny. Dane autoryzacyjne, takie jak kwota autoryzacji oraz dane osobowe, nie są weryfikowane. Fakt dostarczenia deklaracji na bramkę testową nie oznacza zatem, że zostanie dostarczona do Urzędu Skarbowego.
Funkcja Wyślij podpisem kwalifikowanym jest przeznaczona dla Księgowych Prowadzących, którzy wysyłają plik JPK_V7 w imieniu klienta. W takim przypadku dodatkowo powinna zostać wybrana opcja Oświadczam, że dostarczyłem do Urzędu Skarbowego poprawnie wypełniony formularz UPL-1.